联邦星舰发现号在一次测试新型孢子驱动引擎时，意外撕裂了时空壁垒，坠入了一个充斥着暴政与奴役的“镜像宇宙”。在这里，联邦早已覆灭，人类帝国通过铁血统治着星际。更糟糕的是，发现号船员发现这个宇宙也有一个“伯纳姆”，但她是帝国最残暴的舰长，杀害了无数反抗者。为了寻找回去的方法，伯纳姆不得不伪装成那个冷酷无情的自己，登上帝国旗舰。她每天都要面对臣民的暗杀、皇帝的猜忌，以及这个宇宙的“发现号”同伴们——他们都是变态和告密者。在一次任务中，她发现镜像宇宙的孢子驱动并非自然现象，而是由一种被囚禁的宇宙级意识体发出的求救信号。
这一季彻底放飞了“黑暗”属性，将主角置于道德的钢丝上。伯纳姆的演技在这一季中封神，那种在正义与残忍间切换的撕裂感太强了。虽然偏离了传统星际迷航的乐观主义，但平行宇宙的设定提供了极高的戏剧张力，对“如果选择造就了人”的探讨尤其深刻。
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